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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
20/04/2010 |
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Data da última atualização: |
24/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ASSIS, J. B. de; LAAT, D. M. de; PEIXOTO, M. G. C. D.; BERGMANN, J. A. G.; FONSECA, C. G.; CARVALHO, M. R. S. |
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Afiliação: |
J. B. DE ASSIS, UFMG; D. M. DE LAAT, UFMG; MARIA GABRIELA CAMPOLINA D PEIXOTO, CNPGL; JOSÉ AURÉLIO GARCIA BERGMANN, UFMG; C. G. FONSECA, UFMG; M. R. S. CARVALHO, UFMG. |
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Título: |
Genetic diversity and population structure in Brazilian Mangalarga Marchador horses. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 8, n. 4, p. 1519-1524, 2009. |
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DOI: |
https://doi.org/10.4238/vol8-4gmr647 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
One hundred and fifteen unrelated Mangalarga Marchador horses were sampled from three geographically distinct regions of Minas Gerais State, Brazil (South, Southeast, and Northeast) and tested for 10 microsatellite loci. Genetic diversity and population structure parameters were estimated with ARLEQUIN 3.0, CERVUS 2.0, POPGENE 1.31, GENEPOP on the web, STRUCTURE 2.0, and SPAGEDI 1.2 software packages. Under Hardy-Weinberg assumptions, seven markers were at equilibrium (LEX014, LEX017, LEX019, SGCV23, TKY321, VHL20, and VIASH39), while two (ASB3 and LEX031) presented significant homozygote excess. Seventy-four alleles were identified in these nine markers, with a mean of 8.22 alleles. Mean heterozygosity was 0.637 and polymorphism information content was 0.662. Markers ASB3, LEX019, SGCV23, TKY321, and VHL20 were highly informative (PIC >0.7) and may be useful for eventual expansion of parentage test panels. The F(ST) value (0.0562) indicated relatively little geographical structure. However, based on a Bayesian-based cluster analysis under a three-cluster model, 94% of the 115 individuals were correctly assigned to the subpopulations from where they were sampled. Mean pairwise f was relatively high (0.11), and in spite of the efforts towards non-consanguineous sampling, 1% of the pairs of individuals shared over 50% of the alleles. These results strongly suggest that the population is genetically structured. Under a conservation genetics approach, two strategies are recommended: avoidance of crosses between highly endogamic individuals and stimulation of crosses between individuals from those regions for which low genetic flow was identified. MenosOne hundred and fifteen unrelated Mangalarga Marchador horses were sampled from three geographically distinct regions of Minas Gerais State, Brazil (South, Southeast, and Northeast) and tested for 10 microsatellite loci. Genetic diversity and population structure parameters were estimated with ARLEQUIN 3.0, CERVUS 2.0, POPGENE 1.31, GENEPOP on the web, STRUCTURE 2.0, and SPAGEDI 1.2 software packages. Under Hardy-Weinberg assumptions, seven markers were at equilibrium (LEX014, LEX017, LEX019, SGCV23, TKY321, VHL20, and VIASH39), while two (ASB3 and LEX031) presented significant homozygote excess. Seventy-four alleles were identified in these nine markers, with a mean of 8.22 alleles. Mean heterozygosity was 0.637 and polymorphism information content was 0.662. Markers ASB3, LEX019, SGCV23, TKY321, and VHL20 were highly informative (PIC >0.7) and may be useful for eventual expansion of parentage test panels. The F(ST) value (0.0562) indicated relatively little geographical structure. However, based on a Bayesian-based cluster analysis under a three-cluster model, 94% of the 115 individuals were correctly assigned to the subpopulations from where they were sampled. Mean pairwise f was relatively high (0.11), and in spite of the efforts towards non-consanguineous sampling, 1% of the pairs of individuals shared over 50% of the alleles. These results strongly suggest that the population is genetically structured. Under a conservation genetics approach, two strategies are recommen... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Genetic diversity; Mangalarga Marhador horse; Popular genetic structure. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/697088/1/Genetic-diversity-and-population.pdf
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Marc: |
LEADER 02414naa a2200229 a 4500
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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| Registros recuperados : 91 | |
| 6. |  | SANTOS, D. J. DE A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; UTSUNOMIYA, A. T. H.; TONHATI, H.; CARVALHO, M. R. S.; SILVA, M. V. G. B. Análise de associação global para identificar locos relacionados às produções de leite, de gordura e de proteína na raça Guzerá. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 10., 2013, Uberaba. Anais... Viçosa: Sociedade Brasileira de Melhoramento Animal, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 7. | | FONSECA, P. A. S.; STEINBERG, R. S.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; MACHADO, M. A.; FONSECA, C. G.; CARVALHO, M. R. S. Associação de polimorfismos nos genes da kappa-caseina e beta-lactoglubulina com produção e composição do leite na raça Guzerá. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 9. | | CARVALHO, M. R. S.; STEINBERG, R. S.; MACHADO, M. A.; VERNEQUE, R. da S.; TEODORO, R. L.; SANDES, S. H. C.; PEIXOTO, M. G. C. D. Associação dos polimorfismos nos loci da k - caseína e da B - lactoglobulina com parâmetros da produção leiteira na raça Guzerá melhorada para leite. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Aguas de Lindoia. Anais... Águas de Lindóia: SBG, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 10. | | PEIXOTO, M. G. C. D.; MARTINEZ, M. L.; TEODORO, R. L.; CARVALHO, M. R. S.; MACHADO, M. A.; EUCLYDES, R. F.; GOMES, F. C.; VERNEQUE, R. da S. Avaliação e metodologias para validação de QTL utilizando a estrutura de família de um núcleo MOET. In: REUNIÓN ASOCIACÓN LATINOAMERICANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 20., REUNIÓN ASOCIACIÓN PERUANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 30., CONGRESO INTERNACIONAL DE GANADERIA DOBLE PROPOSITO, 5., 2007, Cuzco. Anais... Cuzco: ALPA/APPA, 2007. 1 CD.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
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| 11. | | PEIXOTO, M. G. C. D.; MARTINEZ, M. L.; TEODORO, R. L.; CARVALHO, M. R. S.; MACHADO, M. A.; EUCLYDES, R. F.; GOMES, F. C.; VERNEQUE, R. da S. Avaliação e metodologias para validação de QTL utilizando a estrutura de família de um núcleo MOET. In: REUNIÓN ASOCIACÓN LATINOAMERICANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 20.; REUNIÓN ASOCIACIÓN PERUANA DE PRODUCCIÓN ANIMAL, 30.; CONGRESO INTERNACIONAL DE GANADERIA DOBLE PROPOSITO, 5., 2007, Cuzco. Resumenes... Cuzco: ALPA/APPA, 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 14. | | FONSECA, P. A. S.; LAMOUNIER, P. F.; ROSSE, I. C.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; MACHADO, M. A.; CARVALHO, M. R. S. Polymorphisms in the regulatory regions of genes regulating lipid metabolism in the mammary gland in Guzerat breed (Bos indicus). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 58., 2012, Foz do Iguaçu. Resumos... Foz do Iguaçú: Sociedade Brasileira de Genética, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 15. | | PEIXOTO, M. G. C. D.; FONSECA, C. G.; STEINBERG, R. S.; SOUSA, G. E.; VERNEQUE, R. S.; TEODORO, R. L.; MACHADO, M. A.; CARVALHO, M. R. S. Caracterização das variantes genéticas do gene DGAT1 na raça Guzerá (Bos indicus ) In: CONGRESSO INTERNACIONAL DO LEITE, 6., 2007, Resende. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2007. 1 CD.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
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| 16. | | LACORTE, G. A.; MACHADO, M. A.; CAMPOS, A. L.; SILVA, R. S. da; CARVALHO, M. R. S.; FONSECA, C. G da. Caracterização do poliformismo DGAT1 VNTR em raças bovinas brasileiras. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2007. p. 123.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 17. | | FREITAS, A. C. DE; SOUZA, G. F.; CAMARGO, G. M. F. DE; PEIXOTO, M. G. C. D.; CARVALHO, M. R. S.; TONHATI, H. Caracterização do gene Stearoil-CoA desaturase nas raças gir e guzerá. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 10., 2013, Uberaba. Anais... Viçosa: Sociedade Brasileira de Melhoramento Animal, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 19. | | FONSECA, P. A. S; ROSSE, I. C.; DEMIRANDA, M.; MACHADO, M. A.; VERNEQUE, R. da S.; PEIXOTO, M. G. C. D.; CARVALHO, M. R. S. A new tetra-primer ARMS-PCR for genotyping bovine kappa-casein polymorphisms. Genetics and Molecular Research, v. 12, n. 4, p. 6521-6526, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 20. | | SILVA, R. S. da; PEREIRA, L.; LACORTE, G. A.; MACHADO, M. A.; PEIXOTO, M. G. C. D.; VERNEQUE, R. da S.; CARVALHO, M. R. S. Novo método, simples e econômico para detecção do polimorfismo K232A no gene DGAT1 baseado em tetra-primer ARMS. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA. 45., 2008, Lavras, MG. Anais... Lavras: SBZ / UFLA, 2008. 1 CD.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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